Jako lesní mateřská škola může být označována v současné době pouze ta školka, která spadá do Rejstříku škol a školských zařízení, tedy pod Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy. Pro takovou lesní MŠ platí všechna ustanovení jako pro běžné MŠ (s výjimkou zvláštní hygienické vyhlášky pro lesní MŠ). Na tuto lesní MŠ tedy dohlíží stejné kontrolní orgány jako na běžné MŠ – Česká školní inspekce, Krajská hygienická stanice… Lesní MŠ se řídí stejnými dokumenty jako běžné MŠ apod. V tomto typu předškolního zařízení také dítě může plnit poslední povinný rok docházky do MŠ, neboť tato MŠ je ministerstvem oficiálně uznávána.

Oproti tomu lesní klub je subjektem většinou soukromým, pod MŠMT nespadá, není zapsán v rejstříku škol, tudíž se na něj nevztahuje valná většina vyhlášek, nejsou zde téměř žádné kontrolní orgány. Je plně na iniciativě klubu, jakým způsobem bude jeho fungování ošetřeno. Spousta lesních klubů plní však tzv. Standardy vzdělávání a spadá pod Asociaci lesních mateřských škol, která je určitým způsobem vede a zaštiťuje a oproti lesním MŠ mají tu výhodu, že je nesvazují mnohé byrokratické překážky. Navíc v rámci obsahu vzdělávání se tyto dva subjekty neliší.

Ať už lesní MŠ či klub, všechny jsou postaveny na velmi podobném programu a obsahu. V popředí stojí důraz na environmentální tématiku, zdravý životní styl, rovněž je zde kladen důraz na rozvoj samostatnosti a zodpovědnosti dítěte, ale určitě nesmíme opomíjet ani rozvoj dalších oblastí, dalších vědomostí, dovedností a návyků dítěte.